안녕하세요, 3billion입니다.
저희는 희귀 유전 질환의 진단, 나아가 치료까지 혁신하고자 모인 AI 엔지니어, 생물정보학자, 디자이너, 의학 유전학자, 그리고 세일즈 전문가들로 구성된 팀입니다.
GEBRA™는 유전체 데이터를 분석하고, 희귀 질환 환자의 질환 원인이 되는 변이를 찾을 수 있도록 유전 전문인(임상의, 의학 유전학자, 변이 분석가, 생물정보학자 등)을 지원하기 위해 설계된 클라우드 기반 소프트웨어입니다. 아래 그림은 GEBRA의 구조를 나타낸 것입니다(그림 1).

GEBRA™는 AWS 환경에서 운영되며, 실제 서버 위치는 사용자의 지역에 따라 달라질 수 있습니다.
사용자가 로컬 PC 또는 클라우드를 통해 FASTQ 또는 VCF 파일을 업로드하면, 당사의 파이프라인을 통해 Variant calling과 annotation이 자동으로 진행됩니다.
분석 완료 후에는 결과를 탐색하며 원인 변이를 확인할 수 있습니다.
GEBRA™는 변이 추출 및 필터링을 위해 여러 개의 Variant Caller를 활용합니다.
각 변이 유형과 해당 유형에 사용되는 변이 호출 도구는 아래와 같습니다 (변이 유형: 변이 호출 도구).
- SNV/indel: GATK, Mutect2
- CNV: 3bCNV, MANTA, SMAfinder
- Inversion/Breakend: MANTA
- Insertion: MELT, MANTA
- Repeat Expansion: ExpansionHunter
- ROH(Region/Run of Homozygosity): AutoMap
자세한 내용은 백서의 ‘3billion의 검사 서비스’ 섹션을 참고하세요. (2025년 백서 링크)
3billion의 EVIDENCE는 빠르고 정확한 변이 Annotation을 위해 개발된 소프트웨어입니다.
Varaint Calling 후 각 변이는 여러 데이터베이스와 가이드라인을 기반으로 EVIDENCE에서 Annotation 처리됩니다.
변이의 병리적 분류는 ACMG/AMP 가이드라인 논리를 기반으로 수행됩니다.
자세한 내용은 저희 백서의 ‘EVIDENCE’ 섹션을 참고해 주세요. (2025 백서 링크)
Prioritized Variants(우선순위 변이) 섹션에는 여러 단계의 필터링을 거친 변이들이 표시됩니다.
이 필터들은 베이지안 점수, 적용된 규칙/판단 기준, ClinVar 데이터베이스, 논문 등 다양한 정보를 기반으로 작동합니다.
전체 변이에 있는 변이를 우선순위로 이동하세요.
'All Variants'탭에는 높은 빈도의 인구집단 변이를 제외한 모든 변이가 표시됩니다 (예: SNV의 경우, BA1 기준이 적용된 변이는 표시되지 않습니다).
우선순위 변이(Prioritized variants)도 이 섹션에서 함께 확인할 수 있습니다.
보고서 생성 또는 변이의 자세한 정보 확인이 필요할 경우, 'All Variants' 탭에서 'Priorized' 섹션으로 변이를 이동시켜 관리할 수 있습니다.
또한 필요한 경우
See details → ACMG Classification → Edit → “분류와 상관없이 우선순위 지정(Prioritize this variant regardless of classification)”
옵션을 활성화하여 향후 분석에서도 자동 우선순위 지정이 가능합니다.
데모를 신청하시면 담당자가 빠르게 연락드립니다.

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